Hierarchy For All Packages

Package Hierarchies:

• uni.bielefeld.cmg.reflexiv.io,
• uni.bielefeld.cmg.reflexiv.main,
• uni.bielefeld.cmg.reflexiv.pipeline,
• uni.bielefeld.cmg.reflexiv.serializer,
• uni.bielefeld.cmg.reflexiv.util

Class Hierarchy

• java.lang.Object
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.io.ContigReader (implements java.io.Serializable)
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.util.DefaultParam (implements java.io.Serializable)
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.util.HelpParam
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.util.InfoDumper (implements uni.bielefeld.cmg.reflexiv.util.InfoManager, java.io.Serializable)
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.util.InfoLogger (implements uni.bielefeld.cmg.reflexiv.util.InfoManager)
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.main.Main
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.main.MainOfCounter
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.main.MainOfReAssembler
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.util.Parameter
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.util.ParameterOfCounter
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.util.ParameterOfReAssembler
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.pipeline.Pipelines (implements uni.bielefeld.cmg.reflexiv.pipeline.Pipeline, java.io.Serializable)
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.io.ReadFasta (implements uni.bielefeld.cmg.reflexiv.io.InputFileManager)
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.pipeline.ReflexivCounter (implements java.io.Serializable)
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.pipeline.ReflexivMain (implements java.io.Serializable)
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.pipeline.ReflexivMainTest
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.pipeline.ReflexivReAssembler (implements java.io.Serializable)
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.serializer.SparkKryoRegistrator (implements org.apache.spark.serializer.KryoRegistrator)
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.io.TextFileBufferInput (implements uni.bielefeld.cmg.reflexiv.io.InputFileManager)
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.io.TextFileBufferOutput (implements uni.bielefeld.cmg.reflexiv.io.OutputFileManager)

Interface Hierarchy

• uni.bielefeld.cmg.reflexiv.io.FileManager
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.io.InputFileManager
  • uni.bielefeld.cmg.reflexiv.io.OutputFileManager
• uni.bielefeld.cmg.reflexiv.util.InfoManager
• uni.bielefeld.cmg.reflexiv.pipeline.Pipeline